Η δεύτερη δεκαετία της νέας χιλιετίας θα έφερνε τον ΑΠΟΕΛ σε έναν διαφορετικό επίπεδο και μπορεί με άνεση να χαρακτηριστεί ως η κορυφαία μέχρι στιγμής στην ιστορία της ομάδας.
Παρά το ότι η αρχή είχε γίνει με την πρώτη παρουσία της ομάδας σε όμιλο του UEFA Champions League, την περίοδο 2009-2010 αυτό που θα ακολουθούσε ήταν ένα όνειρο που θα γινόταν προτεραιότητα.
Ο ΑΠΟΕΛ την περίοδο 2010-2011 κατακτά το πρωτάθλημα και ταυτόχρονα το δικαίωμα να διεκδικήσει θέση σε όμιλο του UEFA Champions League.
Έναν στόχο που τον κάνει πραγματικότητα αφού την προηγούμενη περίοδο έχει χάσει στην παράταση από την Getafe και στερείται έτσι της ευκαιρίας να γίνει η πρώτη ομάδα που θα συμμετείχε και στους αγώνες του UEFA Europa League.
Ο ΑΠΟΕΛ αποκλείει λοιπόν την περίοδο 2011-2012 κατά σειρά τις Skenderbeu, Slovan Bratislava και Wisla Krakow για να μπει στην κλήρωση των ομίλων. Εκεί η τύχη φέρνει ενώπιον του τις Zenit St Petersburg, Porto και Shakhtar Donetsk. Ο ΑΠΟΕΛ είναι το απόλυτο αυτσάιντερ. Πετυχαίνει όμως την απόλυτη υπέρβαση καταφέρνοντας να τερματίσει πρώτος στον όμιλο και να προκριθεί στον επόμενο γύρο. Εκεί όπου το βράδυ της 7ης Μαρτίου ή καλύτερα τα ξημερώματα της 8ης Μαρτίου απέναντι στην Lyon θα πετύχαινε αυτό που έμοιαζε ακατόρθωτο. Να προκριθεί στα προημιτελικά της κορυφαίας διασυλλογικής διοργάνωσης κατακτώντας το εισιτήριο στην διαδικασία των πέναλντι.
Στην συνέχεια βρέθηκε στον δρόμο του, η βασίλισσα της Ευρώπης, Real Madrid και με δύο ήττες αλλά και με την επίτευξη δύο γκολ μέσα στο Santiago Bernabeu έγραψε τον επίλογο της κορυφαίας επίδοσης κυπριακής ομάδας στην ιστορία της χώρας.
Αυτό το μαγικό ταξίδι θα περίμενε κάποιος να αποδείξει αν ο ΑΠΟΕΛ θα ήταν τελικά ένας διάττοντας αστέρας ή όχι. Και αυτό που συνέβηκε ήταν το δεύτερο.
Ο ΑΠΟΕΛ από το 2013-2014 σαρώνει τα πάντα στον διάβα του σε τοπικό επίπεδο. Ανατρέπει την κατάρα που δεν τον ήθελε να κερδίζει δεύτερο συνεχόμενο πρωτάθλημα, σπάει το ρεκόρ 6 δεκαετιών με τρίτο συνεχόμενο πρωτάθλημα, προσθέτει 4ο και 5ο τίτλο σπάζοντας την καλύτερη επίδοση στην ιστορία του την περίοδο 2017-2018 με 6 συνεχόμενες κατακτήσεις.
Ταυτόχρονα στην Ευρώπη γίνεται πλέον μόνιμος θαμώνας σε ευρωπαϊκούς ομίλους με 5 συνεχόμενες παρουσίες. Το 2013-2014 σε όμιλο του UEFA Europa League, το 2014-2016 σε όμιλο του UEFA Champions League, το 2015-2016 σε όμιλο του UEFA Europa League. Το 2016-2017 εξασφαλίζει ξανά την παρουσία του σε όμιλο του UEFA Europa League αλλά δεν περιορίζεται μόνο στην συμμετοχή. Τερματίζει πρώτος στον όμιλο ανάμεσα σε Ολυμπιακό Πειραιώς, FC Astana και Young Boys. Κληρώνεται στην φάση των «32» απέναντι στην Athletic Bilbao. Στον πρώτο εκτός έδρας αγώνα χάνει με 3-2. Στον επαναληπτικό κερδίζει με 3-2 και γίνεται η πρώτη κυπριακή ομάδα που αποκλείει ισπανική. Για την φάση των «16» αντιμετωπίζει την Anderlecht και γνωρίζει τον αποκλεισμό. Ήταν η δεύτερη φορά που κυπριακή ομάδα πέρασε στην φάση των νοκ άουτ και πάλι από τον ΑΠΟΕΛ
Το 2017-2018 η ομάδα μας καταφέρνει και πάλι να δηλώσει παρούσα σε όμιλο του UEFA Champions League, για 4η φορά στην ιστορία της και βρέθηκε αντιμέτωπη με την Real Madrid, Tottenham Hotspur και Borussia Dortmund.
